Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRIP1Q9BX63 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms