Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPOQ9BU64 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPOQ9BU64 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms