Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAGR1Q9BTK6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms