Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms