Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM175Q9BSA9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM175Q9BSA9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM175Q9BSA9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM175Q9BSA9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM175Q9BSA9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM175Q9BSA9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM175Q9BSA9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM175Q9BSA9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms