Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms