Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIKE1Q9BRV8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms