Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF559Q9BR84 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms