Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms