Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP9Q99956 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms