Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms