Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUFY1Q96T51 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms