Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRBNQ96SW2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms