Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
JMJD8Q96S16 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JMJD8Q96S16 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms