Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRERF1Q96PN7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms