Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms