Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms