Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIMPOLQ96LW4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOLQ96LW4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms