Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP8Q96LD8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP8Q96LD8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms