Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKNOX2Q96KN3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms