Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC35E1Q96K37 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms