Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms