Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INTS4Q96HW7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms