Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC35A4Q96G79 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC35A4Q96G79 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms