Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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