Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO7Q8WWI1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMO7Q8WWI1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO7Q8WWI1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms