Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC4Q8WW27 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms