Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUQ7

CACTIN, Cactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACTINQ8WUQ7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACTINQ8WUQ7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACTINQ8WUQ7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms