Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms