Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms