Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAVCR2Q8TDQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms