Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELBQ8NG08 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms