Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms