Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM3Q8NE01 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM3Q8NE01 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
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