Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM35BQ8NCS4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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