Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPC24Q8NBT2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms