Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms