Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms