Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FSIP1Q8NA03 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FSIP1Q8NA03 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms