Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71E2Q8N5Q1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms