Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP4Q8N2S1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP4Q8N2S1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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