Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms