Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC84Q86UT8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms