Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBBP6Q7Z6E9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms