Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUFY3Q7L099 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms