Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH2Q76I76 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SSH2Q76I76 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SSH2Q76I76 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SSH2Q76I76 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH2Q76I76 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH2Q76I76 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH2Q76I76 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SSH2Q76I76 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms