Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETMD1Q6P1Q0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms