Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC70Q6NSX1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms