Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF6Q6KF10 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms