Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSAPQ6IQ19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms